С 24 февраля 2022 года принимал участие во вторжении России на Украину. 23 марта 2022 года погиб при выполнении заданий в одном из боёв на Изюмском направлении в Харьковской области. Проживал в Ульяновске. Похоронен 6 апреля 2022 года в посёлке Тоншаево Нижегородской области. Указом Президента Российской Федерации (закрытым) от 18 апреля 2022 года «за героизм и мужество, проявленные при исполнении воинского долга», гвардии майору Ягидарову Денису Сергеевичу было присвоено звание Герой Российской Федерации (посмертно).