Орден Ушакова — высший флотоводческий орден СССР. Морских офицеров практически не награждали «сухопутными» полководческими орденами Суворова, Кутузова, Хмельницкого и Невского. Поэтому возникла необходимость в учреждении специальных флотоводческих наград. Два «морских» ордена — Ушакова и Нахимова, а также две «морских» медали, названные именами тех же адмиралов, были учреждены 3 марта 1944 года.
Идею создания таких наград предложил лично Сталину Нарком Военно-Морского Флота СССР и одновременно Главнокомандующий Военно-Морским Флотом адмирал флота Кузнецов Н.Г. летом 1943 года.
При разработке статутов орденов Ушакова и Нахимова возник спор о том, какая из этих наград должна стоять выше в негласной «табели о рангах». Дело в том, что историки редко упоминали Ушакова. О Нахимове же было написано гораздо больше, и он был хорошо известен народу как герой Крымской войны. Однако адмирал Кузнецов настаивал на том, что «главным» следует поставить орден Ушакова. На счету Ушакова было множество побед и ни одного поражения. Особо следует подчеркнуть роль победы в сражении с турецким флотом у мыса Калиакрия летом 1791 года. Эта победа закрепила престиж России как морской державы и утвердила ее интересы на Черном и Средиземном морях. При Ушакове Россия построила сильный флот и надежные крепости в Крыму, в Днестровском, Бугском и Днепровском лиманах. Приводя весомые аргументы, адмирал Кузнецов убедил приемную комиссию ГКО в целесообразности выделения ордена Ушакова на первое место. Для ознакомления бойцов, командиров и гражданских лиц с подвигами Ушакова издавались специальные листовки, а сразу после войны была снята историческая кинолента «Адмирал Ушаков».
Проект ордена Ушакова разработал начальник организационно-мобилизационного управления Наркомата ВМФ СССР капитан 1-го ранга (впоследствии вице-адмирал) Хомич Б.М. Он также является автором проекта гвардейского военно-морского флага, знаков «Гвардия» для моряков и знака «командир подводной лодки». В разработке проекта ордена принимали участие Шипелевский М.А. и Берков Е.А.
В расцветке орденской ленты использованы цвета Андреевского военно-морского флага императорской России.
Орден Ушакова II степени в числе первых получили на Северном флоте — 10 апреля 1944 года командир бригады подводных лодок капитан 1-го ранга Колышкин И.А. (впоследствии возглавляемая им бригада подводных лодок была награждена орденом Ушакова I степени), капитан 2-го ранга Котов В.Ф., капитан Пирогов В.В. и др. (всего 14 человек). На Черноморском флоте — 20 апреля 1944 года капитан- лейтенант Глухов А.А. На Краснознаменном Балтийском Флоте — 26 июня 1944 года капитан 2-го ранга Белуш М.А., капитан 3-го ранга Гладышев Н.И., капитан-лейтенант Гуманенко В.П.
В числе первых награжденных орденом Ушакова II степени был командующий Азовской военной флотилией контр-адмирал (впоследствии Адмирал Флота Советского Союза) Горшков С.Г., который позднее был награжден и орденом I степени.
Знак ордена Ушакова II степени № 1 был вручен в июле 1944 года командующему Кронштадтским оборонительным районом вице-адмиралу Ралль Ю.Ф. (его прабабушка по материнской линии была племянницей Ф.Ф. Ушакова). Кадровый офицер русского флота Юрий Федорович Ралль до революции командовал миноносцем «Подвижный».
Среди награжденных орденом Ушакова II степени — тринадцать воинских частей и подразделений.
В годы войны были случаи, когда офицер мог быть удостоен и высшего полководческого ордена Суворова и высшего флотоводческого ордена Ушакова. Так, ордена Суворова II степени и Ушакова II степени украшали китель Героя Советского Союза Державина Павла Ивановича. В годы войны он был командиром дивизиона Одесского отряда сторожевых кораблей, затем командиром бригады бронекатеров Азовской и Дунайской военных флотилий. Державин окончил войну в должности командира 1-й Керченско-Венской Краснознаменной бригады речных кораблей Дунайской Военной флотилии.
Всего орденом Ушакова II степени было совершено 194 награждения (в том числе 13 награждений соединений и частей ВМФ).